RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471202.5

CHTF18-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 4,494 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-208ENST00000471202 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PARVBQ9HBI1 364 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 A0A087X1B8 175 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PMM2O15305 246 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 HOXA2O43364 376 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 LRPAP1P30533 357 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 ADRA1BP35368 520 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 TRPC1P48995 793 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 NUP107P57740 925 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 TRAF2Q12933 501 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 RIPK1Q13546 671 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 NRF1Q16656 503 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.71□□□□□ -0.05
CHTF18-208ENST00000471202 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 GSC2O15499 205 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 C2P06681 752 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ANPEPP15144 967 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 TFEBP19484 476 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PRIM2P49643 509 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.067e-16■■■□□ 18.8
CHTF18-208ENST00000471202 RETSATQ6NUM9 610 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 MIEF2Q96C03 454 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 SH3GL1Q99961 368 aa14.71□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 CLOCKO15516 846 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 KDM1AO60341 852 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 DAB1O75553 588 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 VNN1O95497 513 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF682O95780 498 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 FAM35AQ86V20 835 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 SEPT8Q92599 483 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 MYLPFQ96A32 169 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 DPY30Q9C005 99 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 RMND5AQ9H871 391 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 TSPAN8P19075 237 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ATP6V1C1P21283 382 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 S100A5P33763 92 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 GPR142Q7Z601 462 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 SEPT3Q9UH03 358 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ATP6AP2O75787 350 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 GDF10P55107 478 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 RAB10P61026 200 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 MAXP61244 160 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 RNF145Q96MT1 663 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PGK1P00558 417 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 LDLRP01130 860 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 HALP42357 657 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 BFSP2Q13515 415 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PGS1Q32NB8 556 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PPTC7Q8NI37 304 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.7□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 CCDC154A6NI56 674 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 FGFR3P22607 806 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 VAC14Q08AM6 782 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 DLG3Q92796 817 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 MFSD11O43934 449 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 KRT6AP02538 564 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 KRT6BP04259 564 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 KRT6CP48668 564 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 TDRPQ86YL5 185 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CHTF18-208ENST00000471202 FIG4Q92562 907 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms