RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 ACCSLQ4AC99 568 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 TTI2Q6NXR4 508 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 DEFB119Q8N690 84 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 RFFLQ8WZ73 363 aa6.2□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 A0A1B0GVT2 93 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 KIAA0754O94854 1291 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC175P0C221 793 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 NEK5Q6P3R8 708 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 C16orf87Q6PH81 154 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 SLC35F6Q8N357 371 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 C3orf20Q8ND61 904 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 IFT43Q96FT9 208 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 RFPL3O75679 317 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 NNMTP40261 264 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM215Q68D42 235 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.19□□□□□ -1.42
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PTPRR-204ENST00000440835 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 CTAGE9A4FU28 777 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 MED7O43513 233 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 LTFP02788 710 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 PYGLP06737 847 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM49P0CI25 452 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 TRIM49CP0CI26 452 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRR-204ENST00000440835 CD38P28907 300 aa6.18□□□□□ -1.42
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