RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 DSPP15924 2871 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 E9PAM4 449 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 PLK4O00444 970 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ENDOD1O94919 500 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 MT-CO1P00395 513 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CTSLP07711 333 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 TAF3Q5VWG9 929 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 TRNP1Q6NT89 227 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ILVBLA1L0T0 632 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8CPA6NN73 597 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 SNAP91O60641 907 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 PRNPP04156 253 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 MMEP08473 750 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 C1SP09871 688 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 OR1E1P30953 314 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CHRNA3P32297 505 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R38P59533 333 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CAMK2BQ13554 666 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 GANQ9H2C0 597 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0D9SEW6 157 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ENC1O14682 589 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 STAT4Q14765 748 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 TMPRSS12Q86WS5 348 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM145Q8NBT3 493 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CEP44Q9C0F1 390 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 MPP6Q9NZW5 540 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 ITPR1Q14643 2758 aa21.47■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 K7ERQ8 282 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 BNIP3LO60238 219 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 MMP8P22894 467 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 RRM1P23921 792 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CDR2Q01850 454 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 SLC20A2Q08357 652 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 C2CD6Q53TS8 623 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 NAA35Q5VZE5 725 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 RETSATQ6NUM9 610 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 MDM1Q8TC05 714 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 TSC1Q92574 1164 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 HDAC8Q9BY41 377 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.46■■□□□ 1.03
LIMS1-208ENST00000428064 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ZMPSTE24O75844 475 aa21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ACADVLP49748 655 aa21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 JAM2P57087 298 aa21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 DHRS13Q6UX07 377 aa21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 FAM131BQ86XD5 332 aa21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 DYRK4Q9NR20 520 aa21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 IL36AQ9UHA7 158 aa21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 LHX6Q9UPM6 363 aa21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 NBEAQ8NFP9 2946 aa21.45■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 SRGAP2O75044 1071 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 RFPL3O75679 317 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 SOX5P35711 763 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 FMO1Q01740 532 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 ILKQ13418 452 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 KRT31Q15323 416 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 MANEALQ5VSG8 457 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 LINGO4Q6UY18 593 aa21.44■■□□□ 1.02
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.44■■□□□ 1.02
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