RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422847.1

LINC00857-201, long intergenic non-protein coding RNA 857, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00857, Length 2,161 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00857-201ENST00000422847 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 WDR27A2RRH5 827 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TNFSF9P41273 254 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 FLT3LGP49771 235 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 LBX1P52954 281 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 CYTH1Q15438 398 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 STILQ15468 1287 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 CCL14Q16627 93 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 ABHD15Q6UXT9 468 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TOP1MTQ969P6 601 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 EME1Q96AY2 570 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 RCN3Q96D15 328 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 RANBP9Q96S59 729 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 NAT9Q9BTE0 207 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 BCO2Q9BYV7 579 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 WDR41Q9HAD4 459 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TMEM165Q9HC07 324 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 SLC17A6Q9P2U8 582 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 CDH7Q9ULB5 785 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 A0A1B0GTW7 788 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TRIM64CA6NLI5 447 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 SUPT3HO75486 399 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 MICAL2O94851 1124 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 EPHA3P29320 983 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TYK2P29597 1187 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 GP5P40197 560 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 PHKA2P46019 1235 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 ACTR2P61160 394 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 MTA1Q13330 715 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TRNP1Q6NT89 227 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 UNC5BQ8IZJ1 945 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 IER2Q9BTL4 223 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 MTMR10Q9NXD2 777 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 G3V2L1 256 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 MATN2O00339 956 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TRIM38O00635 465 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 PDGFRAP16234 1089 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 GRIA1P42261 906 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 ENTPD1P49961 510 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 PKNOX1P55347 436 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 IKBKEQ14164 716 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 PPM1JQ5JR12 505 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 MORN1Q5T089 497 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 GRTP1Q5TC63 336 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 ZNF280DQ6N043 979 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 NAPRTQ6XQN6 538 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 CNTD1Q8N815 330 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 RIN3Q8TB24 985 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TMIGD2Q96BF3 282 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 CPNE1Q99829 537 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 SNX15Q9NRS6 342 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 MID2Q9UJV3 735 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 GJD2Q9UKL4 321 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TRIM17Q9Y577 477 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 PSAT1Q9Y617 370 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 C7orf72A4D263 438 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 M0QYV0 167 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 NOP56O00567 594 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 MDM4O15151 490 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 OGTO15294 1046 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 HDAC3O15379 428 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TRIM13O60858 407 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 VAPBO95292 243 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TNNC2P02585 160 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 NR3C2P08235 984 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 HOXC6P09630 235 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 P4HA1P13674 534 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00857-201ENST00000422847 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms