RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ASPHQ12797 758 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GADL1Q6ZQY3 521 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGZQ86VD9 579 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC43Q8N309 656 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HPDLQ96IR7 371 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SMOQ99835 787 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NTN4Q9HB63 628 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa3.7□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LAMA3Q16787 3333 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC100653049A0A140TA62 436 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 E7ENX8 843 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP6CO00743 305 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNN4O15554 427 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GLRA3O75311 464 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT34O76011 436 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 AHSGP02765 367 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CD247P20963 164 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 C4orf22Q6V702 233 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HERC6Q8IVU3 1022 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB9Q96DX5 294 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM167AQ96KS9 214 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 IGSF5Q9NSI5 407 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NDFIP2Q9NV92 336 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNK1O00180 336 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CABYRO75952 493 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN12O95859 305 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 INHBAP08476 426 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CD19P15391 556 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 OSBPP22059 807 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL10P27635 214 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC1A6P48664 564 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CHN2P52757 468 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 USP46P62068 366 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SP4Q02446 784 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FOLH1Q04609 750 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GRM3Q14832 879 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC20AQ6ZU45 233 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBTB33Q86T24 672 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HACE1Q8IYU2 909 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PGAM4Q8N0Y7 254 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HDAC11Q96DB2 347 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 C3orf30Q96M34 536 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SCOCQ9UIL1 159 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NEMP2A6NFY4 417 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD28O15084 1053 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK-10P10266 1014 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PHKA2P46019 1235 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HPCAP84074 193 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIP10Q15642 601 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A52Q3SY17 297 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 USP33Q8TEY7 942 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS39Q96JC1 886 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TSGA13Q96PP4 275 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 WRNIP1Q96S55 665 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ATXN10Q9UBB4 475 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRC5Q86WI3 1866 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DOCK4Q8N1I0 1966 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 YJEFN3A6XGL0 299 aa3.69□□□□□ -1.82
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PGGT1B-203ENST00000419445 CPA3P15088 417 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMB4P28070 264 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GJA5P36382 358 aa3.69□□□□□ -1.82
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PGGT1B-203ENST00000419445 SUOXP51687 545 aa3.69□□□□□ -1.82
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PGGT1B-203ENST00000419445 TNFAIP1Q13829 316 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0040Q15053 153 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RFX8Q6ZV50 586 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT8Q9NY28 637 aa3.69□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
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