RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 C14orf80Q86SX3 495 aa20.53■□□□□ 0.88
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SUMO3-204ENST00000411651 VPS45Q9NRW7 570 aa20.53■□□□□ 0.88
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SUMO3-204ENST00000411651 DRGXA6NNA5 263 aa20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 ATP9BO43861 1147 aa20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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SUMO3-204ENST00000411651 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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SUMO3-204ENST00000411651 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.53■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.52■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.52■□□□□ 0.88
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SUMO3-204ENST00000411651 HLA-DQB2P05538 268 aa20.52■□□□□ 0.88
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SUMO3-204ENST00000411651 CSRP3P50461 194 aa20.52■□□□□ 0.88
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SUMO3-204ENST00000411651 CES3Q6UWW8 571 aa20.52■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC43Q8N309 656 aa20.52■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 DCLK2Q8N568 766 aa20.52■□□□□ 0.88
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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SUMO3-204ENST00000411651 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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SUMO3-204ENST00000411651 STX3Q13277 289 aa20.51■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.51■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20.51■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 MBLAC2Q68D91 279 aa20.51■□□□□ 0.87
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SUMO3-204ENST00000411651 MARCH2Q9P0N8 246 aa20.51■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.51■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.51■□□□□ 0.87
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SUMO3-204ENST00000411651 MAPKAPK2P49137 400 aa20.51■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 EFEMP1Q12805 493 aa20.51■□□□□ 0.87
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SUMO3-204ENST00000411651 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
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SUMO3-204ENST00000411651 WWP1Q9H0M0 922 aa20.51■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 RHOJQ9H4E5 214 aa20.51■□□□□ 0.87
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SUMO3-204ENST00000411651 MID2Q9UJV3 735 aa20.51■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.51■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 CENPFP49454 3210 aa20.5■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 VNN2O95498 520 aa20.5■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 SERPINE1P05121 402 aa20.5■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 T-ENOLP0DO92 83 aa20.5■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 PAMP19021 973 aa20.5■□□□□ 0.87
SUMO3-204ENST00000411651 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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