RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395038.6

SOS1-201, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOS1, Length 4,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1-201ENST00000395038 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 HPS6Q86YV9 775 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 GPR78Q96P69 363 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 RTKNQ9BST9 563 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 EBF3Q9H4W6 596 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 BFARQ9NZS9 450 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 DMDP11532 3685 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 SPEGQ15772 3267 aa6.41□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 TRIM13O60858 407 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 SLC34A2O95436 690 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 IGLV3-25P01717 112 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 USP17L7P0C7H9 530 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 ARNTP27540 789 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 PSEN2P49810 448 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 MPP3Q13368 585 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 SENP8Q96LD8 212 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 APOL2Q9BQE5 337 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 IL22Q9GZX6 179 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 DRC3Q9H069 523 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 SCOCQ9UIL1 159 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 E9PBE3 544 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 TK2O00142 265 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 TIMM44O43615 452 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 KLHL41O60662 606 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 AP1G2O75843 785 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 LRIG2O94898 1065 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 TPH1P17752 444 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 MPSTP25325 297 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 JADE3Q92613 823 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 VAT1Q99536 393 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 PTPN18Q99952 460 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 MED10Q9BTT4 135 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 VCXQ9H320 206 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 MIOSQ9NXC5 875 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.4□□□□□ -1.38
SOS1-201ENST00000395038 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 ARHGAP42A6NI28 874 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 MTSS1O43312 755 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 ATP9BO43861 1147 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 AHCYL1O43865 530 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 HSPA4LO95757 839 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 NCAM1P13591 858 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 EPHB1P54762 984 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 IRF5Q13568 498 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 CCL15Q16663 113 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 MORN1Q5T089 497 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 LPCAT4Q643R3 524 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 RDH11Q8TC12 318 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 STYXQ8WUJ0 223 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 PKMYT1Q99640 499 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 ACSS2Q9NR19 701 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 DDIT4Q9NX09 232 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 KRT34O76011 436 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 IGHA2P01877 340 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 AHSGP02765 367 aa6.4□□□□□ -1.39
SOS1-201ENST00000395038 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.7 ms