RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 USP33Q8TEY7 942 aa28.77■■■□□ 2.2
GIPC1-202ENST00000393028 ACDQ96AP0 544 aa28.77■■■□□ 2.2
GIPC1-202ENST00000393028 CEP41Q9BYV8 373 aa28.77■■■□□ 2.2
GIPC1-202ENST00000393028 BRD8Q9H0E9 1235 aa28.77■■■□□ 2.2
GIPC1-202ENST00000393028 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa28.77■■■□□ 2.2
GIPC1-202ENST00000393028 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
GIPC1-202ENST00000393028 WNT16Q9UBV4 365 aa28.77■■■□□ 2.2
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GIPC1-202ENST00000393028 CD160O95971 181 aa28.76■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 SEC13P55735 322 aa28.76■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 ECT2LQ008S8 904 aa28.76■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 KLHL7Q8IXQ5 586 aa28.76■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 SIX5Q8N196 739 aa28.76■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 SPATA4Q8NEY3 305 aa28.76■■■□□ 2.19
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GIPC1-202ENST00000393028 CCDC114Q96M63 670 aa28.76■■■□□ 2.19
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GIPC1-202ENST00000393028 HOMER3Q9NSC5 361 aa28.76■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 SLC25A13Q9UJS0 675 aa28.76■■■□□ 2.19
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GIPC1-202ENST00000393028 ZNF148Q9UQR1 794 aa28.76■■■□□ 2.19
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GIPC1-202ENST00000393028 KCNN4O15554 427 aa28.75■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 SULT2A1Q06520 285 aa28.75■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
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GIPC1-202ENST00000393028 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 HTR3CQ8WXA8 447 aa28.75■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 HCN2Q9UL51 889 aa28.75■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 MATN3O15232 486 aa28.74■■■□□ 2.19
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GIPC1-202ENST00000393028 COILP38432 576 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
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GIPC1-202ENST00000393028 SLC10A7Q0GE19 358 aa28.74■■■□□ 2.19
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GIPC1-202ENST00000393028 TMCO4Q5TGY1 634 aa28.74■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 EMC10Q5UCC4 262 aa28.74■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa28.74■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 EXOC4Q96A65 974 aa28.74■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 MRGPRX3Q96LB0 322 aa28.74■■■□□ 2.19
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GIPC1-202ENST00000393028 ATP11CQ8NB49 1132 aa28.72■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 NSMCE1Q8WV22 266 aa28.72■■■□□ 2.19
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GIPC1-202ENST00000393028 TIMM44O43615 452 aa28.71■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 TARSP26639 723 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 FNTAP49354 379 aa28.71■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF234Q14588 700 aa28.71■■■□□ 2.19
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