RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 SMARCD1Q96GM5 515 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 KIFC1Q9BW19 673 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 VCX3BQ9H321 246 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 TCF7L2Q9NQB0 619 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 MAN1C1Q9NR34 630 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 ASB3Q9Y575 518 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 LRIG2O94898 1065 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 GLDCP23378 1020 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 CALRP27797 417 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 GRM3Q14832 879 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 ZYG11AQ6WRX3 759 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 RAPH1Q70E73 1250 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 MAPK15Q8TD08 544 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 SLC26A7Q8TE54 656 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 EDEM1Q92611 657 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 DPF3Q92784 378 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 TSGA13Q96PP4 275 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 RHOJQ9H4E5 214 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM30AQ9NV96 361 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 CACNG4Q9UBN1 327 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 RAP2CQ9Y3L5 183 aa26.86■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 ASPHQ12797 758 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 ACVR1CQ8NER5 493 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 IRGQQ8WZA9 623 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 PPP2R3CQ969Q6 453 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 TASP1Q9H6P5 420 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 UBP1Q9NZI7 540 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 PDP2Q9P2J9 529 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 POMPQ9Y244 141 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 SRGAP2BP0DMP2 458 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 GNAT1P11488 350 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 LIPMQ5VYY2 423 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 KATNAL1Q9BW62 490 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 DRC3Q9H069 523 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 CABYRO75952 493 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 APBA2Q99767 749 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 CACNG3O60359 315 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 THP07101 528 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJB1P25685 340 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 PEX19P40855 299 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 IFT43Q96FT9 208 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 OR52B2Q96RD2 323 aa26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 MATN2O00339 956 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 CLCNKBP51801 687 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 MTTPP55157 894 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 SATB1Q01826 763 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXD13-201ENST00000392539 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 MEIS3P2A8K0S8 358 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA8TH3BQL2 631 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 HDAC3O15379 428 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 THRAP10827 490 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 MPSTP25325 297 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 PCSK1P29120 753 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 RPL14P50914 215 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 USP10Q14694 798 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 UGP2Q16851 508 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 PCID2Q5JVF3 399 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 SEL1L3Q68CR1 1132 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 TAC4Q86UU9 113 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 STON2Q8WXE9 905 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 RNF34Q969K3 372 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 CNDP1Q96KN2 507 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 AP5M1Q9H0R1 490 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 OSBPL2Q9H1P3 480 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 SMIM24O75264 130 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 ZMPSTE24O75844 475 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 LYNP07948 512 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 COL6A2P12110 1019 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 GRIA4P48058 902 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 XIAPP98170 497 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 PEX6Q13608 980 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 SLC12A1Q13621 1099 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 OTOP3Q7RTS5 596 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 PDSS2Q86YH6 399 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 HPS6Q86YV9 775 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 CNTD1Q8N815 330 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 SCYL1Q96KG9 808 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 GAD1Q99259 594 aa26.82■■□□□ 1.88
HOXD13-201ENST00000392539 TSC22D3Q99576 134 aa26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms