RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 BNIP3LO60238 219 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 GZMAP12544 262 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 OR1E1P30953 314 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 PBX1P40424 430 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 KCNT1Q5JUK3 1230 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 DCAF4L2Q8NA75 395 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ATP11CQ8NB49 1132 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 OR7D4Q8NG98 312 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SLC6A18Q96N87 628 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SCNM1Q9BWG6 230 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 PPM1HQ9ULR3 514 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 GLDCP23378 1020 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 RRM1P23921 792 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CCR5P51681 352 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 RACK1P63244 317 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 FAM46CQ5VWP2 391 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 LINGO4Q6UY18 593 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 FAM131CQ96AQ9 280 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CEP295Q9C0D2 2601 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ALOX15BO15296 676 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CBFA2T3O75081 653 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 GPD1P21695 349 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ADRA1BP35368 520 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 PPP2CBP62714 309 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 PPP2CAP67775 309 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 SPON2Q9BUD6 331 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 HAUS4Q9H6D7 363 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CACNA1BQ00975 2339 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CHD5Q8TDI0 1954 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D3EA0A087X179 549 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ILVBLA1L0T0 632 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D3LB9A6J9 549 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 WNT9AO14904 365 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 RTN2O75298 545 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 WNT1P04628 370 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CTSLP07711 333 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D3HP0C7X1 549 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CTSKP43235 329 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 HDAC4P56524 1084 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CNTN1Q12860 1018 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ST3GAL2Q16842 350 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 WDR59Q6PJI9 974 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF783Q6ZMS7 281 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 DBX2Q6ZNG2 339 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 DRC7Q8IY82 874 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 OSBPL2Q9H1P3 480 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 OR12D3Q9UGF7 316 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 H0Y8X5 98 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 VILLO15195 856 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 SLC7A4O43246 635 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 AIF1P55008 147 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ZBED6P86452 979 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 MANEALQ5VSG8 457 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 AGBL4Q5VU57 503 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 VPS36Q86VN1 386 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 OR2A12Q8NGT7 310 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 NTAN1Q96AB6 310 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM11Q96F44 468 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 TSPY26PQ9H489 355 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 PARVAQ9NVD7 372 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CAPN11Q9UMQ6 739 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 FAM72CH0Y354 149 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CBX4O00257 560 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-201ENST00000378543 CBFA2T2O43439 604 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms