RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SERPINA6P08185 405 aa15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 UNC5BQ8IZJ1 945 aa15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 VPS28Q9UK41 221 aa15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 FAM50BQ9Y247 325 aa15.61■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 GLTPD2A6NH11 291 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SYCE1LA8MT33 242 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 COX4I1P13073 169 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 VAV1P15498 845 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 YWHAQP27348 245 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 TTC30AQ86WT1 665 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 TDRPQ86YL5 185 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 LGI2Q8N0V4 545 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SIX4Q9UIU6 781 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 TCEA3O75764 348 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ITGA2BP08514 1039 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ME2P23368 584 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 KLRC2P26717 231 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 NNMTP40261 264 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 TLDC1Q6P9B6 456 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ELMOD1Q8N336 334 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 MARCH2Q9P0N8 246 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 LRRC42Q9Y546 428 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 VCLP18206 1134 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 IVDP26440 423 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ABL2P42684 1182 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 RENBPP51606 427 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 RAD51Q06609 339 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 CDC16Q13042 620 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 MAPRE2Q15555 327 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 DDI1Q8WTU0 396 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 AZIN2Q96A70 460 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 CASS4Q9NQ75 786 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 DSEQ9UL01 958 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 METTL18O95568 372 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 CNTFP26441 200 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 CD86P42081 329 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 OXCT1P55809 520 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 NEPROQ6NW34 567 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 AMIGO2Q86SJ2 522 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SLCO2A1Q92959 643 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 LRRC39Q96DD0 335 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 MFSD3Q96ES6 412 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 TRIM15Q9C019 465 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 PRKAG3Q9UGI9 489 aa15.6■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 CCL22O00626 93 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 TRIM16O95361 564 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 PSEN1P49768 467 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 CCL23P55773 120 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 GSTA3Q16772 222 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 FAM110CQ1W6H9 321 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 TMC7Q7Z402 723 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 SNX19Q92543 992 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 RCN3Q96D15 328 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 S100A14Q9HCY8 104 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 C4AP0C0L4 1744 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 C4BP0C0L5 1744 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 CLUHO75153 1309 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 ATP6AP2O75787 350 aa15.59■□□□□ 0.09
FGD1-201ENST00000375135 DDHD2O94830 711 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms