RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 STK32CQ86UX6 486 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPL10Q9BXB5 764 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RCCD1A6NED2 376 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SNX3O60493 162 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 GRM5P41594 1212 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MARCKSL1P49006 195 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF558Q96NG5 402 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ADCY6O43306 1168 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ERBB2P04626 1255 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CSH1P0DML2 217 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CSH2P0DML3 217 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CHKAP35790 457 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CD86P42081 329 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 FUT2Q10981 343 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 DPP10Q8N608 796 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SUSD6Q92537 303 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RERGLQ9H628 205 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 UBXN8O00124 270 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA5P08758 320 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 DUPD1Q68J44 220 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC103Q8IW40 242 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF839A8K0R7 811 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MEI4A8MW99 385 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PGK1P00558 417 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ERCC2P18074 760 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF544Q6NX49 715 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 FAM228AQ86W67 206 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SETD9Q8NE22 299 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PDE5AO76074 875 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA6P08133 673 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC166P0CW27 439 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MATKP42679 507 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ABCG1P45844 678 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 IRF8Q02556 426 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PFKFB4Q16877 469 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PALB2Q86YC2 1186 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ALG9Q9H6U8 611 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 RAD18Q9NS91 495 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT17P0C025 328 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 GRK4P32298 578 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ART4Q93070 314 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 HSMCR30P0CW71 290 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 HDCP19113 662 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 GPR142Q7Z601 462 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 SYBUQ9NX95 663 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ADGRB2O60241 1585 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CACNA2D1P54289 1103 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 DDR2Q16832 855 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 LUZP2Q86TE4 346 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 DLG3Q92796 817 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 MAGED4Q96JG8 741 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf16Q9BUW7 83 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ASB8Q9H765 288 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 COPG2Q9UBF2 871 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 DLGAP3O95886 979 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 CRADDP78560 199 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TTMPQ5BVD1 217 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms