RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364234.1

RNU6-11P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 11, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-11P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-11P-201ENST00000364234 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 MYZAPP0CAP1 466 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CKMT1AP12532 417 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 LYL1P12980 280 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 XBP1P17861 261 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 HNF1BP35680 557 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 MAPK9P45984 424 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 GAD2Q05329 585 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZBTB16Q05516 673 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 TRPC3Q13507 836 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ATG16L1Q676U5 607 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 GJB7Q6PEY0 223 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 LRRC8DQ7L1W4 858 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CCDC25Q86WR0 208 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMEM217Q8N7C4 229 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 SCAIQ8N9R8 606 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMEM174Q8WUU8 243 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 FAR1Q8WVX9 515 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 NLRP4Q96MN2 994 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 AAMDCQ9H7C9 122 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ALKBH4Q9NXW9 302 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 GRHL1Q9NZI5 618 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ANAPC4Q9UJX5 808 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 GJD2Q9UKL4 321 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 A0A0G2JK05 382 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 MYMKA6NI61 221 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 PEX12O00623 359 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 NCAM2O15394 837 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CREB3O43889 395 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 EPN2O95208 641 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 DDAH2O95865 285 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CHRM4P08173 479 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 MMP3P08254 477 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 YWHAQP27348 245 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 PGM1P36871 562 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 MTNR1AP48039 350 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 RASSF2P50749 326 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CLCNKBP51801 687 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 IL13RA2Q14627 380 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ENTPD8Q5MY95 495 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 Q5PR19 223 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 RNF144BQ7Z419 303 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 WDR5BQ86VZ2 330 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZNF366Q8N895 744 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZMIZ2Q8NF64 920 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 LPAR1Q92633 364 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 EME1Q96AY2 570 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 RNFT2Q96EX2 444 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 VCPIP1Q96JH7 1222 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CTDSP1Q9GZU7 261 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ACAD9Q9H845 621 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZNF304Q9HCX3 659 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMEM160Q9NX00 188 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 RRN3Q9NYV6 651 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 PDP2Q9P2J9 529 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 RNF7Q9UBF6 113 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 UPB1Q9UBR1 384 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 COG5Q9UP83 839 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ICKQ9UPZ9 632 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CNPY2Q9Y2B0 182 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 A0A096LPK6 155 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 NDUFB8O95169 186 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 BMP15O95972 392 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 SERPINC1P01008 464 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 IL1AP01583 271 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CHRNB1P11230 501 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 UNGP13051 313 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 GPR12P47775 334 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 POLD2P49005 469 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 MAPK7Q13164 816 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 PTGR1Q14914 329 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 AP5B1Q2VPB7 878 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 ALFQ53S48 1182 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 HMBOX1Q6NT76 420 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 RETSATQ6NUM9 610 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 PARM1Q6UWI2 310 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 COLCA1Q6ZS62 124 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 CPOQ8IVL8 374 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-11P-201ENST00000364234 GHDCQ8N2G8 530 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.2 ms