RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ATP2A3Q93084 1043 aa18.25■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.25■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ACTL7AQ9Y615 435 aa18.25■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CHADO15335 359 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ETS2P15036 469 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CCNFP41002 786 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 PPP2R5DQ14738 602 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ARTNQ5T4W7 220 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 UNC5AQ6ZN44 842 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC77Q9BR77 488 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 GRID1Q9ULK0 1009 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 E7ESA3 106 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 KRT4P19013 534 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 PDK1Q15118 436 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SNX30Q5VWJ9 437 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 FAM47EQ6ZV65 393 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 C17orf50Q8WW18 174 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 NTAN1Q96AB6 310 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM221A6NGB7 291 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 IGLV3-25P01717 112 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 YWHAQP27348 245 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CCR1P32246 355 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SMYD5Q6GMV2 418 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 RFWD3Q6PCD5 774 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ARL10Q8N8L6 244 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 GATA6Q92908 595 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 BHMTQ93088 406 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SIGLEC10Q96LC7 697 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SLC39A8Q9C0K1 460 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 TRABDQ9H4I3 376 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 PRKAG3Q9UGI9 489 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa18.24■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 NFKB1P19838 968 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 TARSP26639 723 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 PRMT2P55345 433 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SCAPQ12770 1279 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 RAP1GAP2Q684P5 730 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CNTD1Q8N815 330 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 HAPLN3Q96S86 360 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CENPKQ9BS16 269 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CWH43Q9H720 699 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 GKN1Q9NS71 199 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 HAO1Q9UJM8 370 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 DNAH14Q0VDD8 3507 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SLC12A8A0AV02 714 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SYN3O14994 580 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 E2F6O75461 281 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 GJB5O95377 273 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 F9P00740 461 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 MAP7Q14244 749 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 RNF43Q68DV7 783 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SPRED2Q7Z698 418 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 TRABD2AQ86V40 505 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 KLHL5Q96PQ7 755 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 TBX21Q9UL17 535 aa18.23■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 E9PAM4 449 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ATP9BO43861 1147 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 GARSP41250 739 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 OCRLQ01968 901 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC15Q0P6D6 951 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 IKBKEQ14164 716 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CROCCP2Q86T23 111 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 MON1AQ86VX9 555 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 IRGQQ8WZA9 623 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 IGSF8Q969P0 613 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SLC9A7Q96T83 725 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SMOC2Q9H3U7 446 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 WBP1LQ9NX94 342 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 SYBUQ9NX95 663 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 ZCCHC18P0CG32 403 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CSH1P0DML2 217 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CSH2P0DML3 217 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 WDR4P57081 412 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 MAXP61244 160 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 MGAT5Q09328 741 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 GPR17Q13304 367 aa18.22■□□□□ 0.51
PDE4D-204ENST00000358923 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms