RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354662.5

LMO3-204, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,574 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-204ENST00000354662 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TAGAPQ8N103 731 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 EID3Q8N140 333 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 CD101Q93033 1021 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 IDI2Q9BXS1 227 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ACOT9Q9Y305 439 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.38□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 FAM205CA6NFA0 338 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 H3BMM5 538 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 LRRN2O75325 713 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 PDGFAP04085 211 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 MYL4P12829 197 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 MATN1P21941 496 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 RRM1P23921 792 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 NPTX2P47972 431 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 PPP5CP53041 499 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TNFAIP2Q03169 654 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 MGAT3Q09327 533 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TFCP2Q12800 502 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TRIM32Q13049 653 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 NFIL3Q16649 462 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 LRRC20Q8TCA0 184 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 FKBP10Q96AY3 582 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SYT11Q9BT88 431 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TINAGQ9UJW2 476 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 PDHXO00330 501 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 APOL1O14791 398 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 AXIN1O15169 862 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 C7P10643 843 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 CTSWP56202 376 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 CENPCQ03188 943 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 NME3Q13232 169 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ZNF124Q15973 351 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 Q5BKY6 102 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 XKRXQ6PP77 449 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ARSKQ6UWY0 536 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 CPA6Q8N4T0 437 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TEX47Q8TBZ9 253 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 CSF3RQ99062 836 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 PIP5K1AQ99755 562 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 BRD9Q9H8M2 597 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ANKHQ9HCJ1 492 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SYBUQ9NX95 663 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 GLTPQ9NZD2 209 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 HDAC9Q9UKV0 1011 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 A0A1W2PPM1 405 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 E5RJQ4 531 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 EML1O00423 815 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 UGT2B11O75310 529 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 UPK1BO75841 260 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 NTSR2O95665 410 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 ACADMP11310 421 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SERPINB5P36952 375 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 HTR3AP46098 478 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 PRIM2P49643 509 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SLC18A2Q05940 514 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SLC12A1Q13621 1099 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TEX44Q53QW1 395 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TMEM65Q6PI78 240 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 SLC9A6Q92581 669 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 TBCBQ99426 244 aa8.37□□□□□ -1.07
LMO3-204ENST00000354662 IL12RB2Q99665 862 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms