RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000350881.6

THBS4-201, Transcript of thrombospondin 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4-201ENST00000350881 HALP42357 657 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 PRAMEP78395 509 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 LGSNQ5TDP6 509 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 SMYD1Q8NB12 490 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 ASB7Q9H672 318 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 DMTF1Q9Y222 760 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.71□□□□□ -0.05
THBS4-201ENST00000350881 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 HMBSP08397 361 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SLC5A3P53794 718 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 POU5F1BQ06416 359 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 OGFOD2Q6N063 350 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 CXorf38Q8TB03 319 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 RNF139Q8WU17 664 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 LZICQ8WZA0 190 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 CCDC28BQ9BUN5 200 aa14.71□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 C9IYK1 514 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 HDCP19113 662 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 PAX3P23760 479 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 EPHX2P34913 555 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 GJA9P57773 515 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 CTBP1Q13363 440 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 STILQ15468 1287 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 IPMKQ8NFU5 416 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SLC35B4Q969S0 331 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ASB14A6NK59 587 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 NDUFB5O43674 189 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 PGK1P00558 417 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ETV4P43268 484 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 GRM2Q14416 872 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SPDYAQ5MJ70 313 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 TMEM198Q66K66 360 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ZNF567Q8N184 647 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 APBA2Q99767 749 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 CHRNGP07510 517 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ERCC2P18074 760 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 BRCC3P46736 316 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ZNF534Q76KX8 674 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 MCUQ8NE86 351 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 GPAMQ9HCL2 828 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 TMEM247A6NEH6 219 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 C9JVG2 144 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 TSPAN3O60637 253 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 CAPN15O75808 1086 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 BDNFP23560 247 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 NME5P56597 212 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 CDKL1Q00532 357 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SULT2A1Q06520 285 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 LAYNQ6UX15 382 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 XKR5Q6UX68 686 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 ZNF410Q86VK4 478 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 Q9H521 79 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 TK2O00142 265 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 HSPA4LO95757 839 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 LTFP02788 710 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 EPHA3P29320 983 aa14.69□□□□□ -0.06
THBS4-201ENST00000350881 CPOXP36551 454 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms