RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 DAOAP59103 153 aa7.4□□□□□ -1.22
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PTPRR-202ENST00000342084 SNAPC2Q13487 334 aa7.4□□□□□ -1.22
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PTPRR-202ENST00000342084 SNX31Q8N9S9 440 aa7.4□□□□□ -1.22
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PTPRR-202ENST00000342084 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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PTPRR-202ENST00000342084 NUMBP49757 651 aa7.4□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 PNPLA4P41247 253 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 CHRNA4P43681 627 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRR-202ENST00000342084 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 GK3PQ14409 553 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 ZYG11AQ6WRX3 759 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 ACAD11Q709F0 780 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRR-202ENST00000342084 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.39□□□□□ -1.23
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