RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 USP29Q9HBJ7 922 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CROTQ9UKG9 612 aa6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 H0YGN5 161 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 KCNN4O15554 427 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 IFNB1P01574 187 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 NFKBIAP25963 317 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GABRR2P28476 465 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SERPINB6P35237 376 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ITGA8P53708 1063 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 COG7P83436 770 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CYP4F8P98187 520 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GPS1Q13098 491 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CALCOCO2Q13137 446 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GAREM2Q75VX8 874 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TNS4Q8IZW8 715 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 NPWQ8N729 165 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 NETO2Q8NC67 525 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 BBOF1Q8ND07 529 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CLUHO75153 1309 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PER2O15055 1255 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 IRF1P10914 325 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CCNCP24863 283 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CHKAP35790 457 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ATP6V1E1P36543 226 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CORO7P57737 925 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 PDK1Q15118 436 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LILRB2Q8N423 598 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CABS1Q96KC9 395 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 KLC2Q9H0B6 622 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ASAH2Q9NR71 780 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GKN1Q9NS71 199 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ANAPC5Q9UJX4 755 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 WASH4PA8MWX3 477 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TP73O15350 636 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ACSL4O60488 711 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TMEM127O75204 238 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RFPL2O75678 378 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 STC2O76061 302 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FGF19O95750 216 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MYL4P12829 197 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 VAV1P15498 845 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TACR2P21452 398 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HOXA9P31269 272 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 NRLP54845 237 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CAV1Q03135 178 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 AP1B1Q10567 949 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TXNDC8Q6A555 127 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HDXQ7Z353 690 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GLMNQ92990 594 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 AZIN2Q96A70 460 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LRRC45Q96CN5 670 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 GCNAQ96QF7 691 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FMO2Q99518 471 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 LGMNQ99538 433 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 CCT7Q99832 543 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 FUT8Q9BYC5 575 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 MPP6Q9NZW5 540 aa6.19□□□□□ -1.42
CCR6-201ENST00000341935 SATB2Q9UPW6 733 aa6.19□□□□□ -1.42
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