RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 CCR10P46092 362 aa20.58■□□□□ 0.88
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PPP1CC-201ENST00000335007 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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PPP1CC-201ENST00000335007 P2RY11Q96G91 374 aa20.55■□□□□ 0.88
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PPP1CC-201ENST00000335007 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.55■□□□□ 0.88
PPP1CC-201ENST00000335007 HES2Q9Y543 173 aa20.55■□□□□ 0.88
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