RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 FRS2Q8WU20 508 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF670Q9BS34 389 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.6■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PSTPIP1O43586 416 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 KRT1P04264 644 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 DGKEP52429 567 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NDST2P52849 883 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SERINC3Q13530 473 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 KDM1BQ8NB78 822 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NELL1Q92832 810 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CKAP5Q14008 2032 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 KDELR3O43731 214 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SRCP12931 536 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ST8SIA6P61647 398 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 MAP7D3Q8IWC1 876 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SLC35F6Q8N357 371 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PTPRN2Q92932 1015 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 RNF157Q96PX1 679 aa20.59■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ATP9BO43861 1147 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 FTCDO95954 541 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 GABRG2P18507 467 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 HOXA6P31267 233 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 FNTBP49356 437 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PEX5P50542 639 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 COPAP53621 1224 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PARP15Q460N3 678 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 ANO7Q6IWH7 933 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 RASSF3Q86WH2 238 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.58■□□□□ 0.89
RAB11B-201ENST00000328024 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 J3KR12 359 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 SIN3BO75182 1162 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 ETFBP38117 255 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 E2F5Q15329 346 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 LLGL1Q15334 1064 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 DLG2Q15700 870 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 TAZQ16635 292 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 APBB3O95704 486 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 CTNNA2P26232 953 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 HMGB4Q8WW32 186 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 ALG3Q92685 438 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 PDFQ9HBH1 243 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 DONSONQ9NYP3 566 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 SUN2Q9UH99 717 aa20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF487B1APH4 448 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 DFFAO00273 331 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 MFSD11O43934 449 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 MAP3K6O95382 1288 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 NDUFV2P19404 249 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 CDKN2BP42772 138 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 ADCY2Q08462 1091 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 RETSATQ6NUM9 610 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 LZTR1Q8N653 840 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 PRRX2Q99811 253 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 EBF1Q9UH73 591 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 AMFRQ9UKV5 643 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 DMDP11532 3685 aa20.55■□□□□ 0.88
RAB11B-201ENST00000328024 USP34Q70CQ2 3546 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms