RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERMP1Q7Z2K6 904 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 GANCQ8TET4 914 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUSD2Q9UGT4 822 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SARDHQ9UL12 918 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 FZD4Q9ULV1 537 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf47A7E2U8 309 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 TM4SF5O14894 197 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCF2LO15068 1137 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CREB3O43889 395 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPHB2P29323 1055 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRD3P35462 400 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM14Q14142 442 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL31Q6EBC2 164 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 RETSATQ6NUM9 610 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSG4Q86SJ6 1040 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2A12Q8NGT7 310 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM131CQ96AQ9 280 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJC7Q99615 494 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPAS1Q99814 870 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 OMDQ99983 421 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 THAP2Q9H0W7 228 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEUROG2Q9H2A3 272 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM9BQ9NQ34 198 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPM1HQ9ULR3 514 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP4E1Q9UPM8 1137 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCOR2Q9Y618 2525 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf142B7Z368 130 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 BNIP3LO60238 219 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAMP2O60895 175 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRCH4O75427 683 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD160O95971 181 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTSLP07711 333 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOT1P17174 413 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIPP30301 263 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETFBP38117 255 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA9Q16790 459 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDDC3Q8N4P3 179 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf216Q8TAB5 229 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX19Q92543 992 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 BIRC7Q96CA5 298 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEH1Q9H213 219 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTL7AQ9Y615 435 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLXNA2O75051 1894 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GTW7 788 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASH4PA8MWX3 477 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLK4O00444 970 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV4-34P06331 123 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNSP15586 552 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPK8P45983 427 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALCP54803 685 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADPRHP54922 357 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA0895LQ68EN5 471 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCEH1Q6PIU2 408 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHST14Q8NCH0 376 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF26Q96DR7 871 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 ORAI3Q9BRQ5 295 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP44Q9C0F1 390 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNKS2Q9H2K2 1166 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCSK1NQ9UHG2 260 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF8O76064 485 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 FSBPO95073 299 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTR7P34969 479 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 TPI1P60174 286 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC20A2Q08357 652 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 POM121L1PQ3SYA9 428 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC122Q5T0U0 273 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM46CQ5VWP2 391 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T34Q8NGX1 318 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC114Q96M63 670 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms