RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 NLRP14Q86W24 1093 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNJLQ8IV13 435 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 TP53INP2Q8IXH6 220 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 POF1BQ8WVV4 589 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 TEKT5Q96M29 485 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 SAMD11Q96NU1 681 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 GCNAQ96QF7 691 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC39A8Q9C0K1 460 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 TLR9Q9NR96 1032 aa10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01553A4QN01 128 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf71A6NGG8 1288 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf67F2Z3F1 127 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MAFKO60675 156 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH16O75309 829 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM63AO94886 807 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 OAS1P00973 400 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 C8AP07357 584 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PFKLP17858 780 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC25CP30307 473 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1E1P30953 314 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 RENBPP51606 427 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVFC1P60507 584 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PARP15Q460N3 678 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TTMPQ5BVD1 217 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PPM1LQ5SGD2 360 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 FAXCQ5TGI0 409 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 AFMIDQ63HM1 303 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC8BQ6P9F7 803 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKMY2Q8IV38 441 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 DENND1CQ8IV53 801 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF683Q8IZ20 524 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LGI2Q8N0V4 545 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NETO2Q8NC67 525 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO36Q8NEA4 188 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 FATE1Q969F0 183 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 AGAP3Q96P47 875 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NAT9Q9BTE0 207 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF38Q9H0F5 515 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TRPC7Q9HCX4 862 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 HAUS2Q9NVX0 235 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 RSPH14Q9UHP6 348 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TSC2P49815 1807 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LCHNA4D1U4 455 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 KRBA1A5PL33 1030 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM23A6NLE4 172 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 RASA4BC9J798 803 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 RASA4O43374 803 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 RAMP2O60895 175 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN11O75508 207 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ANXA9O76027 345 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 STC2O76061 302 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LATS1O95835 1130 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GSTA2P09210 222 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 FURINP09958 794 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRR2P28476 465 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ELK3P41970 407 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP13P45452 471 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH4P55283 916 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NR1H3Q13133 447 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf22Q49AR2 442 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 SYCP2LQ5T4T6 812 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 EMC10Q5UCC4 262 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 PLPP4Q5VZY2 271 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TAOK1Q7L7X3 1001 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00523Q86TU6 105 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF354CQ86Y25 554 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 IGSF8Q969P0 613 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CYTH2Q99418 400 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GBA3Q9H227 469 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 GKN1Q9NS71 199 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 BFARQ9NZS9 450 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 FETUBQ9UGM5 382 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 NEU3Q9UQ49 428 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF510Q9Y2H8 683 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX264Q9Y6I9 313 aa10.32□□□□□ -0.76
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP350Q5VT06 3117 aa10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms