RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316881.8

TRIM25-201, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM25, Length 5,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-201ENST00000316881 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 HAO1Q9UJM8 370 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TMCO1Q9UM00 188 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 CES1P23141 567 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TRAF2Q12933 501 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 SYT12Q8IV01 421 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 LRRC39Q96DD0 335 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 BGNP21810 368 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 GABRR2P28476 465 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TUSC3Q13454 348 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 DGKZQ13574 1117 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 HGH1Q9BTY7 390 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.51□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 UMPSP11172 480 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ELNP15502 786 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 PRMT2P55345 433 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF24P17028 368 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 CYP3A7P24462 503 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 OR1D2P34982 312 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 CD86P42081 329 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 CDK7P50613 346 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 APODP05090 189 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 KDELR1P24390 212 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 RBL1P28749 1068 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF844Q08AG5 666 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 KLHL35Q6PF15 583 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF786Q8N393 782 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 MT-CO1P00395 513 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 SOX6P35712 828 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 CDK16Q00536 496 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ALG11Q2TAA5 492 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 KCNK18Q7Z418 384 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 COMMD2Q86X83 199 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 RIPK2O43353 540 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TLR5O60602 858 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 SERPINB3P29508 390 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 S100A3P33764 101 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 SLC1A6P48664 564 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TTPAP49638 278 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 BIKQ13323 160 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.097e-20■■■■■ 31.9
TRIM25-201ENST00000316881 CALB2P22676 271 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 MACC1Q6ZN28 852 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 KRT73Q86Y46 540 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 CCDC154A6NI56 674 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 DSELQ8IZU8 1212 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 PROX1Q92786 737 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 A0A0A0MRY4 1105 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 MEIS2O14770 477 aa14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRIM25-201ENST00000316881 GRM3Q14832 879 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms