RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 VPS11Q9H270 941 aa21.89■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 UBP1Q9NZI7 540 aa21.89■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ATXN10Q9UBB4 475 aa21.89■■□□□ 1.1
MESP1-201ENST00000300057 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ETV4P43268 484 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 USP46P62068 366 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 GPNMBQ14956 572 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 NRG4Q8WWG1 115 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 MTBPQ96DY7 904 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 APOL2Q9BQE5 337 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 MANSC1Q9H8J5 431 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 TRHDEQ9UKU6 1024 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.89■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 MAP3K7O43318 606 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 CCDC22O60826 627 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 SOAT2O75908 522 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 GNRH1P01148 92 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 RASIP1Q5U651 963 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 CCNJLQ8IV13 435 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 SYN3O14994 580 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 DHRS4L1P0CG22 281 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 SERPINB9P50453 376 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 NIPAL4Q0D2K0 466 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 CDKL2Q92772 493 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 GMIPQ9P107 970 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 SCML2Q9UQR0 700 aa21.88■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 POLBP06746 335 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 PBX3P40426 434 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 CYS1Q717R9 158 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 RASSF3Q86WH2 238 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 C8orf48Q96LL4 319 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 TEKT5Q96M29 485 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 SERPINB11Q96P15 392 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 VAT1Q99536 393 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 NAT9Q9BTE0 207 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ERVK-10P10266 1014 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 COG7P83436 770 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 BFSP2Q13515 415 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 PPP2R5DQ14738 602 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 KCTD11Q693B1 232 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 MON1AQ86VX9 555 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ZNF398Q8TD17 642 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 CASD1Q96PB1 797 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 TMCO1Q9UM00 188 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 PSAT1Q9Y617 370 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.87■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 C2CD2LO14523 706 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 COQ9O75208 318 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 PSMG1O95456 288 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 BGNP21810 368 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 CCNFP41002 786 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 OVGP1Q12889 678 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 TCTN1Q2MV58 587 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 MANEALQ5VSG8 457 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ZNF280DQ6N043 979 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 C14orf80Q86SX3 495 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 LCA5Q86VQ0 697 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 NDUFAF2Q8N183 169 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 NPHS2Q9NP85 383 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 BFARQ9NZS9 450 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 MPP6Q9NZW5 540 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.86■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa21.85■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 COL6A1P12109 1028 aa21.85■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 CPB1P15086 417 aa21.85■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 SLC11A1P49279 550 aa21.85■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 CNPY1Q3B7I2 92 aa21.85■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 PACS1Q6VY07 963 aa21.85■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 DPF3Q92784 378 aa21.85■■□□□ 1.09
MESP1-201ENST00000300057 APBB2Q92870 758 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms