RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000275036.11

HMGN3-201, Transcript of high mobility group nucleosomal binding domain 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-201ENST00000275036 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.78□□□□□ -0.04
HMGN3-201ENST00000275036 ILVBLA1L0T0 632 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 RNF103O00237 685 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.053e-8■■■□□ 15.7
HMGN3-201ENST00000275036 WNT9AO14904 365 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ZMPSTE24O75844 475 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 LRIG2O94898 1065 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ADH1BP00325 375 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 IL1BP01584 269 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SKILP12757 684 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 C5AR1P21730 350 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 CD27P26842 260 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 KRT83P78385 493 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 KIF19Q2TAC6 998 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 HLA-BQ31612 363 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 NAXDQ8IW45 347 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 DRC7Q8IY82 874 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 PYROXD2Q8N2H3 581 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 NTAN1Q96AB6 310 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 OMDQ99983 421 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SLC32A1Q9H598 525 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 FZD4Q9ULV1 537 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.77□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 KCNK3O14649 394 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 MCF2LO15068 1137 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 CBFA2T3O75081 653 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 WNT1P04628 370 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 CTSLP07711 333 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 C1QTNF9P0C862 333 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 GOT1P17174 413 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ADPRHP54922 357 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 PPP2CBP62714 309 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 PPP2CAP67775 309 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ARF5P84085 180 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 GNA12Q03113 381 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SCAPQ12770 1279 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SLC14A1Q13336 389 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 MAMLD1Q13495 774 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 FIGNQ5HY92 759 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SLC6A18Q96N87 628 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.76□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 A0A1W2PPC4 97 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 CBX4O00257 560 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 BNIP3LO60238 219 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 KRT37O76014 449 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 CD160O95971 181 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 RHOQP17081 205 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 PTMSP20962 102 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ACVRL1P37023 503 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 GRIA4P48058 902 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 UBASH3AP57075 661 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 HGSNATQ68CP4 663 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 CNPY3Q9BT09 278 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 SPON2Q9BUD6 331 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 TRIM7Q9C029 511 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 DNAI1Q9UI46 699 aa14.75□□□□□ -0.05
HMGN3-201ENST00000275036 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms