RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ANAPC2Q9UJX6 822 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 VPS4AQ9UN37 437 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TSPAN19P0C672 248 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 COX7A2P14406 83 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 VAV1P15498 845 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LBPP18428 481 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GTF2BQ00403 316 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ALFQ53S48 1182 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 STXBP5Q5T5C0 1151 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PROSER1Q86XN7 944 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ALLCQ8N6M5 410 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OMA1Q96E52 524 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 EPB41L4BQ9H329 900 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PIGUQ9H490 435 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ENO4A6NNW6 628 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FCHO1O14526 889 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NDUFB5O43674 189 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MGRN1O60291 552 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATP6V0D1P61421 351 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FKBP1BP68106 108 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ENPEPQ07075 957 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 POU6F1Q14863 301 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RORBQ92753 470 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TATDN2Q93075 761 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF558Q96NG5 402 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MTMR9Q96QG7 549 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CAPN10Q9HC96 672 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 C2CD2Q9Y426 696 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 A0A087WXM4 84 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BTN3A1O00481 513 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ASNA1O43681 348 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FGFR1P11362 822 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NOS3P29474 1203 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 XIAPP98170 497 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TRAF3Q13114 568 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 IRGCQ6NXR0 463 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TMC7Q7Z402 723 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TMEM199Q8N511 208 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF276Q8N554 614 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF614Q8N883 585 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TCP10LQ8TDR4 215 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MYDGFQ969H8 173 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 REEP1Q9H902 201 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PRMT3O60678 531 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATP6V1B1P15313 513 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RAG1P15918 1043 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NPR3P17342 541 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 STX4Q12846 297 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FAM46CQ5VWP2 391 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 C11orf74Q86VG3 221 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MREGQ8N565 214 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SLC35C1Q96A29 364 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 C1orf50Q9BV19 199 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZYG11BQ9C0D3 744 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MUC13Q9H3R2 512 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CPA4Q9UI42 421 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PSME2Q9UL46 239 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PQ67 120 aa7.31□□□□□ -1.24
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