RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 MED4Q9NPJ6 270 aa6.71□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.71□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CHKBQ9Y259 395 aa6.71□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EFR3BQ9Y2G0 817 aa6.71□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.71□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.71□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ALOX15BO15296 676 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RAMP2O60895 175 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PTPN7P35236 360 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NRIP1P48552 1158 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM25Q86YD3 366 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SEMA3CQ99985 751 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 H0Y626 953 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 LINC01565O15544 149 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ATP8B1O43520 1251 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CTSAP10619 480 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 AVPR1AP37288 418 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EPHB3P54753 998 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RAB33AQ14088 237 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ANO4Q32M45 955 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GPR158Q5T848 1215 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PPM1EQ8WY54 764 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 F5H5T6 163 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ACSL4O60488 711 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GLUD1P00367 558 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 F11P03951 625 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CCT5P48643 541 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EFHBQ8N7U6 833 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 IRGQQ8WZA9 623 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TEKT5Q96M29 485 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SLC9A7Q96T83 725 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CA4P22748 312 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SCNN1AP37088 669 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MAGEA11P43364 429 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SCAPQ12770 1279 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ARCQ7LC44 396 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SERAC1Q96JX3 654 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.7□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 VAPBO95292 243 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 EFEMP2O95967 443 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PYGBP11216 843 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GALNT2Q10471 571 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 SLC1A5Q15758 541 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ACCSLQ4AC99 568 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MANEALQ5VSG8 457 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 NLRP14Q86W24 1093 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 AGR3Q8TD06 166 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PIDD1Q9HB75 910 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 C5orf60A6NFR6 353 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 CTPS1P17812 591 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 OVGP1Q12889 678 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.69□□□□□ -1.34
CNIH1-201ENST00000216416 MARC1Q5VT66 337 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms