RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004201.7

Col5a3-201, Transcript of Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col5a3, Length 6,119 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fubp1Q91WJ8 651 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cog2Q921L5 731 aa14.68□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm7086A0A1W2P766 342 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Osbpl8B9EJ86 889 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stx4P70452 298 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nat9Q3UG98 241 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nab1Q61122 486 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rfwd3Q8CIK8 774 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tfap2dQ91ZK0 452 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dip2bQ3UH60 1574 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Smok3cA0A087WSF2 504 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Smok3aC0HKC8 504 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Smok3bC0HKC9 504 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Usp46P62069 366 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stard3Q61542 446 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cd34Q64314 382 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Txndc8Q69AB2 127 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 SynpoQ8CC35 929 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prdm5Q9CXE0 599 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Aqp5Q9WTY4 265 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Iqsec2Q5DU25 1478 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 DgkdE9PUQ8 1220 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vmn2r1O70410 912 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prl2c2P04095 224 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ptcd3Q14C51 685 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 RogdiQ3TDK6 287 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lrrc8bQ5DU41 803 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 SvopQ8BFT9 548 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Guf1Q8C3X4 651 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Acsm2Q8K0L3 575 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr1352Q8VGX5 309 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HemgnQ9ERZ0 503 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 RereQ80TZ9 1558 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm14692A2BH01 229 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Klhl42Q8BFQ9 493 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Erich5Q8K0S2 362 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sorcs3Q8VI51 1219 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rnf135Q9CWS1 417 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gpn3Q9D3W4 284 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mapk11Q9WUI1 364 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfp472B0V2W5 534 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc16a8O35308 492 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HmbsP22907 361 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mbtd1Q6P5G3 631 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Bend6Q6PFX2 281 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Thap3Q8BJ25 218 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc26a5Q99NH7 744 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 CoprsQ9CQ13 173 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Snx29Q9D3S3 818 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Krt81Q9ERE2 481 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ulk2Q9QY01 1037 aa14.67□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 LeprP48356 1162 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PklrP53657 574 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 VclQ64727 1066 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Plbd1Q8VCI0 550 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 TfQ921I1 697 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Myl9Q9CQ19 172 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ndufb5Q9CQH3 189 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem68Q9D850 329 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 NumbQ9QZS3 653 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Setbp1Q9Z180 1582 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 2210011C24RikA0A087WQ89 206 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm35911A0A1D5RLS7 214 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Glt8d2Q640P4 349 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Arl10Q9QXJ4 243 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Scnn1bQ9WU38 638 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pramef6A2A8M8 474 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Spata6lB2RV46 347 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Otol1Q4ZJM7 482 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Abhd15Q5F2F2 459 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Plin5Q8BVZ1 463 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mgat5Q8R4G6 740 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gprc5bQ923Z0 410 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rassf3Q99P51 232 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trpm5Q9JJH7 1158 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ap3m1Q9JKC8 418 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vnn3Q9QZ25 500 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc6a21A0A1B0GSD2 748 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Foxn2E9Q7L6 429 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 TnfP06804 235 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 En2P09066 324 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vav1P27870 845 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 RragdQ7TT45 449 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PolbQ8K409 335 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Stard13Q923Q2 1113 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ssr3Q9DCF9 185 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa14.66□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa14.65□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cd151O35566 253 aa14.65□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kcnt1Q6ZPR4 1224 aa14.65□□□□□ -0.06
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Copg2Q9QXK3 871 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.1 ms