RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MUC3B	Q9H195	1237 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	VPS28	Q9UK41	221 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRD1	A4D1F6	860 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MT-CO1	P00395	513 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	VAV1	P15498	845 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	COL9A1	P20849	921 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PRKCH	P24723	683 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	AVPR2	P30518	371 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	IL12RB1	P42701	662 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	SATB1	Q01826	763 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MTA1	Q13330	715 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRC32	Q14392	662 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF234	Q14588	700 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	ALG3	Q92685	438 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	HMCES	Q96FZ2	354 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MYO19	Q96H55	970 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCARB2-222	ENST00000640634		K7ERQ8	282 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	DCLK1	O15075	740 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC1A1	P43005	524 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TNFRSF4	P43489	277 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	GNA12	Q03113	381 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ADCY2	Q08462	1091 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	RINL	Q6ZS11	566 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CACUL1	Q86Y37	369 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	PQLC3	Q8N755	202 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	KCTD6	Q8NC69	237 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM71B	Q8TC56	605 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	NELL2	Q99435	816 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SPON2	Q9BUD6	331 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		11.21	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TTC34	A8MYJ7	566 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634		H3BRJ5	948 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CBX4	O00257	560 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	DAPK3	O43293	454 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	MFSD11	O43934	449 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	KRT7	P08729	469 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	KRT10	P13645	584 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	KDELR1	P24390	212 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ARL4A	P40617	200 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ARF5	P84085	180 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	DMWD	Q09019	674 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCARB2-222	ENST00000640634		A0A1W2PQF6	199 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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