RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	C19orf60	Q96EN9	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF862	O60290	1169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MARK3	P27448	753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PML	P29590	882 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PLA2G4A	P47712	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	EPHB1	P54762	984 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CEP68	Q76N32	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF597	Q96LX8	424 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TLE6	Q9H808	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PLOD2	O00469	737 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF623	O75123	536 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HTR1B	P28222	390 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	FDFT1	P37268	417 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TUB	P50607	506 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	REST	Q13127	1097 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	STARD8	Q92502	1023 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GJA10	Q969M2	543 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MSH4	O15457	936 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NAT2	P11245	290 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CCR1	P32246	355 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	SLC9A3	P48764	834 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	GPC5	P78333	572 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DMWD	Q09019	674 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NAB1	Q13506	487 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	EID3	Q8N140	333 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CYTH2	Q99418	400 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	NCAN	O14594	1321 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ABLIM1	O14639	778 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF263	O14978	683 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	HMOX2	P30519	316 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	ARF5	P84085	180 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	CDH18	Q13634	790 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TCF4-280	ENST00000636751	TCEA2	Q15560	299 aa		4.9	□□□□□ -1.62

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