RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 FZD3Q9NPG1 666 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS28Q9UK41 221 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PPM1HQ9ULR3 514 aa28.13■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 MYLKQ15746 1914 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQU0 124 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ALOX15BO15296 676 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP9BO43861 1147 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CSO75390 466 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 AKT2P31751 481 aa28.12■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 PLK1P53350 603 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CENPCQ03188 943 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 EVA1BQ9NVM1 165 aa28.12■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF19Q8IW93 802 aa28.11■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR13H1Q8NG92 308 aa28.11■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP46Q8IYW2 2715 aa28.1■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CDCP2Q5VXM1 449 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL22Q6P050 247 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 APOLD1Q96LR9 279 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 MED15Q96RN5 788 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 DDIT4Q9NX09 232 aa28.1■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV3-25P01717 112 aa28.09■■■□□ 2.09
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC2A3P11169 496 aa28.09■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 ERVPABLB-1P60509 514 aa28.08■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 MUC3BQ9H195 1237 aa28.08■■■□□ 2.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF284Q2VY69 593 aa28.07■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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CAPNS1-217ENST00000629983 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
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CAPNS1-217ENST00000629983 STIM1Q13586 685 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF5Q15542 800 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 C3orf38Q5JPI3 329 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 NEK5Q6P3R8 708 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP11CQ8NB49 1132 aa28.06■■■□□ 2.08
CAPNS1-217ENST00000629983 IFI44Q8TCB0 444 aa28.06■■■□□ 2.08
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