RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596148.2

TRAPPC5-204, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 5,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-204ENST00000596148 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.53■□□□□ 0.88
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TRAPPC5-204ENST00000596148 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.53■□□□□ 0.88
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TRAPPC5-204ENST00000596148 ZNF614Q8N883 585 aa20.51■□□□□ 0.87
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TRAPPC5-204ENST00000596148 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
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TRAPPC5-204ENST00000596148 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC5-204ENST00000596148 FLT3LGP49771 235 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC5-204ENST00000596148 SLC16A1P53985 500 aa20.5■□□□□ 0.87
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TRAPPC5-204ENST00000596148 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC5-204ENST00000596148 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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