RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589998.5

ILF3-217, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ILF3, Length 2,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-217ENST00000589998 GRIA4P48058 902 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 BCAT1P54687 386 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 USP46P62068 366 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PAOXQ6QHF9 649 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 DEFB106AQ8N104 65 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 MFSD3Q96ES6 412 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 STRNO43815 780 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 TSPAN1O60635 241 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 MATKP42679 507 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 MPP3Q13368 585 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 APOFQ13790 326 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 MARK4Q96L34 752 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 BFARQ9NZS9 450 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 COX16Q9P0S2 106 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 DMTF1Q9Y222 760 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa20.24■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PDGFRBP09619 1106 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 ME2P23368 584 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 LIPMQ5VYY2 423 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 VPS39Q96JC1 886 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 TASP1Q9H6P5 420 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PREBQ9HCU5 417 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 SLC22A2O15244 555 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 TIMM44O43615 452 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 AP2A1O95782 977 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 JUNP05412 331 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 TFEBP19484 476 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PGGT1BP53609 377 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 MID2Q9UJV3 735 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 SBK3P0C264 359 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 CLCN2P51788 898 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 USP41Q3LFD5 358 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 NXNQ6DKJ4 435 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 KCNMB4Q86W47 210 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 UNC93AQ86WB7 457 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 DLG3Q92796 817 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.23■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PTPN3P26045 913 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PPP2R5DQ14738 602 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 LINC01465Q8N7H1 131 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 MCMBPQ9BTE3 642 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 CDYLQ9Y232 598 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 CAPNS1P04632 268 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 HSPA13P48723 471 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 PRKAA1Q13131 559 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 ART3Q13508 389 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 HERC3Q15034 1050 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 NLRP7Q8WX94 980 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 IL22Q9GZX6 179 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 ZBTB26Q9HCK0 441 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 CASS4Q9NQ75 786 aa20.22■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 SBF1O95248 1867 aa20.21■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.21■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 APOA4P06727 396 aa20.21■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 GRM5P41594 1212 aa20.21■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 GLRBP48167 497 aa20.21■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 NAGLUP54802 743 aa20.21■□□□□ 0.83
ILF3-217ENST00000589998 DPYSQ14117 519 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms