RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF599Q96NL3 588 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ASB16Q96NS5 453 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PHACTR1Q9C0D0 580 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 S1PR5Q9H228 398 aa31.72■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH23Q9H251 3354 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 H0Y626 953 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 RENBPP51606 427 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 POTEHQ6S545 545 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 MREGQ8N565 214 aa31.71■■■□□ 2.67
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa31.71■■■□□ 2.67
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CAPNS1-206ENST00000588815 MTHFRP42898 656 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK16Q00536 496 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA5AQ13591 1074 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SLMAPQ14BN4 828 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM153CQ494X1 144 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa31.7■■■□□ 2.66
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF354CQ86Y25 554 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
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CAPNS1-206ENST00000588815 E2F7Q96AV8 911 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 APOL5Q9BWW9 433 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDND1Q9NY35 253 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM153AQ9UHL3 310 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH7Q9ULB5 785 aa31.7■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TPSB2P20231 275 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TNK2Q07912 1038 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH18Q13634 790 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ11Q14654 390 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TPSAB1Q15661 275 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 CARNMT1Q8N4J0 409 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RIN3Q8TB24 985 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ETNK1Q9HBU6 452 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 HAUS2Q9NVX0 235 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 HPCAL4Q9UM19 191 aa31.69■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MIA3Q5JRA6 1907 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP8B1O43520 1251 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF11O60813 436 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TBX10O75333 385 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 JCHAINP01591 159 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB17Q13105 803 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MFN1Q8IWA4 741 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 GBA3Q9H227 469 aa31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 KDELR3O43731 214 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL18O95568 372 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNAR2P48551 515 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC12A1Q13621 1099 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM78AQ5JUQ0 283 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SPDYCQ5MJ68 293 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TMCO4Q5TGY1 634 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 FYB2Q5VWT5 728 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 FIBINQ8TAL6 211 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 SPHK2Q9NRA0 654 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MARK1Q9P0L2 795 aa31.67■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 NEBLO76041 1014 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX11BO96011 259 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ACVRL1P37023 503 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ADGRE1Q14246 886 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MARC1Q5VT66 337 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 IL31Q6EBC2 164 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TPGS1Q6ZTW0 290 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 HDXQ7Z353 690 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TMC3Q7Z5M5 1100 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 TEX26Q8N6G2 289 aa31.66■■■□□ 2.66
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CAPNS1-206ENST00000588815 IRF7Q92985 503 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MSLNLQ96KJ4 702 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MUC3BQ9H195 1237 aa31.66■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0D9SEW6 157 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6CA6NDK9 693 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6BA6NDN3 693 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 E7EVH7 732 aa31.65■■■□□ 2.66
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CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6DP0CG33 693 aa31.65■■■□□ 2.66
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CAPNS1-206ENST00000588815 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 MCUQ8NE86 351 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52K2Q8NGK3 314 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 OSCP1Q8WVF1 389 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 NECTIN4Q96NY8 510 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 AGAP3Q96P47 875 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 PDFQ9HBH1 243 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP13A1Q9HD20 1204 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa31.65■■■□□ 2.66
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