RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM129BQ96TA1 746 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 HINFPQ9BQA5 517 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 CD248Q9HCU0 757 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 CD93Q9NPY3 652 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 NCDNQ9UBB6 729 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 TFR2Q9UP52 801 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.97□□□□□ -1.29
EFTUD2-211ENST00000588374 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFS2O75306 463 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF217O75362 1048 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 RHOBTB1O94844 696 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PROSCO94903 275 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 DNTTP04053 509 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SRCP12931 536 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TNNT1P13805 278 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ERCC2P18074 760 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC25BP30305 580 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC8A1P32418 973 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 P2RY2P41231 377 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPKAPK2P49137 400 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 DNA2P51530 1060 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TPMTP51580 245 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SEMA3BQ13214 749 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SPA17Q15506 151 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC6Q16204 474 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PLK5Q496M5 336 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM1BQ8NB78 822 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 NETO2Q8NC67 525 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 KCTD6Q8NC69 237 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2T3Q8NH03 318 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 GANCQ8TET4 914 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SPACA7Q96KW9 195 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 KLC2Q9H0B6 622 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGEH1Q9H213 219 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 EPC1Q9H2F5 836 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS51Q9UID3 782 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 INTUQ9ULD6 942 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.96□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 WASH4PA8MWX3 477 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 RASA4BC9J798 803 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BRJ5 948 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 RASA4O43374 803 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 BUB1O43683 1085 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 KDELR3O43731 214 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP9BO43861 1147 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 RAMP2O60895 175 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ZMPSTE24O75844 475 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFA10O95299 355 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 LCA5LO95447 670 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 CD160O95971 181 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 IL1BP01584 269 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 PYGBP11216 843 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL4AP40617 200 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP25P42331 645 aa6.95□□□□□ -1.3
EFTUD2-211ENST00000588374 HCAR3P49019 387 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms