RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 PSMB7Q99436 277 aa18.77■□□□□ 0.6
CTIF-206ENST00000588345 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa18.77■□□□□ 0.6
CTIF-206ENST00000588345 SPEGQ15772 3267 aa18.77■□□□□ 0.6
CTIF-206ENST00000588345 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D3EA0A087X179 549 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D3LB9A6J9 549 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 F8VZ95 297 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D3HP0C7X1 549 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 SRCP12931 536 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 NUDT1P36639 197 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 DEUP1Q05D60 604 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 SCAPQ12770 1279 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 SHBQ15464 509 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 ACCSLQ4AC99 568 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TCP11X2Q5H9J9 407 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 AGBL4Q5VU57 503 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 Q6ZVU0 165 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 ARCQ7LC44 396 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 ERICH1Q86X53 443 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 EPS8L1Q8TE68 723 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 SERAC1Q96JX3 654 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 STK33Q9BYT3 514 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TMEM59LQ9UK28 342 aa18.76■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 PLK4O00444 970 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 YKT6O15498 198 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 RTN2O75298 545 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 RHOCP08134 193 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 FLT3P36888 993 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 NXPH1P58417 271 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 KRT83P78385 493 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 IL9RQ01113 521 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 CNTN1Q12860 1018 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 SLC45A4Q5BKX6 768 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TAF3Q5VWG9 929 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TRNP1Q6NT89 227 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 CLEC17AQ6ZS10 378 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TRIM69Q86WT6 500 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 DCAF4L2Q8NA75 395 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 MUC3BQ9H195 1237 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 GDF3Q9NR23 364 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 DMTF1Q9Y222 760 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 DOCK9Q9BZ29 2069 aa18.75■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 MT-CO1P00395 513 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 MMEP08473 750 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 CLCN6P51797 869 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 NOMO3P69849 1222 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 LRRC31Q6UY01 552 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 IQCHQ86VS3 1027 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 GALNT15Q8N3T1 639 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 MFSD2AQ8NA29 543 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 MSANTD4Q8NCY6 345 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 SAP25Q8TEE9 199 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 HAPLN3Q96S86 360 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 GANQ9H2C0 597 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 ZNF212Q9UDV6 495 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 VPS51Q9UID3 782 aa18.74■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 E9PAM4 449 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TLR4O00206 839 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 SNAP91O60641 907 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 CTSLP07711 333 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 ZNF18P17022 549 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 RXRGP48443 463 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 C2CD6Q53TS8 623 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 C6orf118Q5T5N4 469 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 ZNF677Q86XU0 584 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 GATAD2AQ86YP4 633 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 OXR1Q8N573 874 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 OR2A12Q8NGT7 310 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 PREBQ9HCU5 417 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 FTSJ1Q9UET6 329 aa18.73■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 A0A0D9SEW6 157 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-206ENST00000588345 GOLGA8CPA6NN73 597 aa18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms