RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TSNQ15631 228 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 GORASP1Q9BQQ3 440 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 LIASO43766 372 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SNX3O60493 162 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 OR56A5P0C7T3 313 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 RAB27AP51159 221 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PCYOX1Q9UHG3 505 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MYL4P12829 197 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 NRF1Q16656 503 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 RETSATQ6NUM9 610 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 VAT1Q99536 393 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MAN1C1Q9NR34 630 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CASZ1Q86V15 1759 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM43BA6NCK2 446 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 FGFR1P11362 822 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PSMB4P28070 264 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ABCG1P45844 678 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 FGD3Q5JSP0 725 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 RNF43Q68DV7 783 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ITIH5Q86UX2 942 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 DLG3Q92796 817 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 INVSQ9Y283 1065 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ALLCQ8N6M5 410 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TBCDQ9BTW9 1192 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CPA4Q9UI42 421 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CHKBQ9Y259 395 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 NCANO14594 1321 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CYP3A4P08684 503 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJB2P25686 324 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MTA1Q13330 715 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 H3BN98 237 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CYP7B1O75881 506 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 YWHAQP27348 245 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CSNK2BP67870 215 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF276Q8N554 614 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 27.6
PTPRM-211ENST00000580170 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CHN2P52757 468 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 GPSM1Q86YR5 675 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 OR52K1Q8NGK4 314 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 FAM45AQ8TCE6 357 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CATSPERZQ9NTU4 200 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KPNA6O60684 536 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MMP13P45452 471 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MFSD10Q14728 455 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF605Q86T29 641 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 CRADDP78560 199 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 SLC25A3Q00325 362 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 MCOLN3Q8TDD5 553 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ACP6Q9NPH0 428 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 TNS2Q63HR2 1409 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 AXLP30530 894 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF410Q86VK4 478 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 KCNH1O95259 989 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF621Q6ZSS3 439 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 FAM83AQ86UY5 434 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ART4Q93070 314 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 REPS1Q96D71 796 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 YME1L1Q96TA2 773 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ARMC7Q9H6L4 198 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 ENOPH1Q9UHY7 261 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 DEPDC5O75140 1603 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 BANF1O75531 89 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 PCDH8O95206 1070 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 NOS3P29474 1203 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 S100A3P33764 101 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRM-211ENST00000580170 FLT3P36888 993 aa21.65■■□□□ 1.06
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