RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 SCAPQ12770 1279 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 PIP4P1Q86T03 277 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 MINDY1Q8N5J2 469 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 AADATQ8N5Z0 425 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 FAM172AQ8WUF8 416 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 PPM1HQ9ULR3 514 aa30.13■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 A0A1W2PP55 124 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 MCF2LO15068 1137 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 MT-CO1P00395 513 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 SRCP12931 536 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 CEACAM1P13688 526 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 GALCP54803 685 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 UAP1L1Q3KQV9 507 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 DNAJC24Q6P3W2 148 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 DSG4Q86SJ6 1040 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa30.12■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 KNL1Q8NG31 2342 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 SNAP91O60641 907 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 ZMPSTE24O75844 475 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 IGHV4-34P06331 123 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 TNFAIP3P21580 790 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 CD27P26842 260 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 CLCN6P51797 869 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 GRIK2Q13002 908 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 SLC14A1Q13336 389 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 KIAA0895LQ68EN5 471 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 LRSAM1Q6UWE0 723 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 OR8D1Q8WZ84 308 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 OMDQ99983 421 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 TAS2R14Q9NYV8 317 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 NEU3Q9UQ49 428 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 OPHN1O60890 802 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 SERPINC1P01008 464 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 IL1BP01584 269 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 RRM1P23921 792 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 DRD3P35462 400 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 PBX1P40424 430 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 PSMD8P48556 350 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 BNC1Q01954 994 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 ACCSLQ4AC99 568 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 LUZP1Q86V48 1076 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 NLRP14Q86W24 1093 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC185Q8N715 623 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 OR2T34Q8NGX1 318 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 GANCQ8TET4 914 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 CNPY3Q9BT09 278 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 SARDHQ9UL12 918 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 PCNX2A6NKB5 2137 aa30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 TPRP12270 2363 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 FAM72CH0Y354 149 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 GZMAP12544 262 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 RHOQP17081 205 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 SLC20A2Q08357 652 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 ASIC2Q16515 512 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 FAM72AQ5TYM5 149 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 SFMBT2Q5VUG0 894 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 FAM46CQ5VWP2 391 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 FAM72DQ6L9T8 149 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 Q6ZVU0 165 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 FAM72BQ86X60 149 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 HDDC3Q8N4P3 179 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 OR7D4Q8NG98 312 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 HAUS4Q9H6D7 363 aa30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 LRRC72A6NJI9 287 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 LRIG2O94898 1065 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 CD59P13987 128 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 MAPKAPK2P49137 400 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 CCR5P51681 352 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 FANCCQ00597 558 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 GNA12Q03113 381 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 NCEH1Q6PIU2 408 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 OR2A12Q8NGT7 310 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 MCEEQ96PE7 176 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 MAGEB5Q9BZ81 275 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 TM9SF3Q9HD45 589 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 TMEM248Q9NWD8 314 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 ACACBO00763 2458 aa30.08■■■□□ 2.41
RAB40C-211ENST00000568586 CEP295Q9C0D2 2601 aa30.07■■■□□ 2.4
RAB40C-211ENST00000568586 ANKRD62A6NC57 917 aa30.07■■■□□ 2.4
RAB40C-211ENST00000568586 K7ERQ8 282 aa30.07■■■□□ 2.4
RAB40C-211ENST00000568586 GIPC1O14908 333 aa30.07■■■□□ 2.4
RAB40C-211ENST00000568586 SLC7A4O43246 635 aa30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms