RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-210ENST00000567271 MAGEH1Q9H213 219 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-210ENST00000567271 SPAG17Q6Q759 2223 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-210ENST00000567271 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-210ENST00000567271 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.14■■□□□ 1.14
NME3-210ENST00000567271 CBX4O00257 560 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 RAMP2O60895 175 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 PROSCO94903 275 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ACADMP11310 421 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 SRCP12931 536 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ZBTB16Q05516 673 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 DLG2Q15700 870 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ACCSLQ4AC99 568 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 IL31Q6EBC2 164 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CACUL1Q86Y37 369 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 FAM129BQ96TA1 746 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 HINFPQ9BQA5 517 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ZWILCHQ9H900 591 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 OSGEPQ9NPF4 335 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 INTUQ9ULD6 942 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 EPN2O95208 641 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 LCA5LO95447 670 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 IGLV3-19P01714 112 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 VAV1P15498 845 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 FECHP22830 423 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 TPMTP51580 245 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 SLC20A2Q08357 652 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 DPYSL2Q16555 572 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 RETSATQ6NUM9 610 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 LINGO4Q6UY18 593 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 STK40Q8N2I9 435 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ZNF292O60281 2723 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 K7ERQ8 282 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 DNTTP04053 509 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 RARAP10276 462 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 GOT1P17174 413 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CD6P30203 668 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 HCAR3P49019 387 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CLCN6P51797 869 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ARF5P84085 180 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 RFX8Q6ZV50 586 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 TMEFF1Q8IYR6 380 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 TEKT4Q8WW24 435 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 DONSONQ9NYP3 566 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CHD5Q8TDI0 1954 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 DAPK3O43293 454 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 MTA2O94776 668 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 OXTRP30559 389 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 MAGEA1P43355 309 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 TCEAL1Q15170 157 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 Q6ZVU0 165 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CPNE8Q86YQ8 564 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 RFFLQ8WZ73 363 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 HSPH1Q92598 858 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 KDELR3O43731 214 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CD160O95971 181 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 ERCC2P18074 760 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 TGM1P22735 817 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 MAN1A1P33908 653 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 SSR1P43307 286 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NME3-210ENST00000567271 CST6Q15828 149 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms