RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 HES2Q9Y543 173 aa4.13□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 IPPQ9Y573 584 aa4.13□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.13□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 NF1P21359 2839 aa4.13□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ABCA7Q8IZY2 2146 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ZNF213O14771 459 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 OPA1O60313 960 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 RAMP2O60895 175 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 IPO13O94829 963 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 STBD1O95210 358 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 GAAP10253 952 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 MYL4P12829 197 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ITGB6P18564 788 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 SLC9A1P19634 815 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 SDSP20132 328 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ADCY2Q08462 1091 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CCDC173Q0VFZ6 552 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 RUNX3Q13761 415 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ZNF174Q15697 407 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 UBE2SQ16763 222 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 FBXO43Q4G163 708 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CEP55Q53EZ4 464 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 DHRS13Q6UX07 377 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ZNF410Q86VK4 478 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 TMPRSS12Q86WS5 348 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ERICH1Q86X53 443 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 IQCA1Q86XH1 822 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ITPRIPQ8IWB1 547 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CNNM3Q8NE01 707 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CUL5Q93034 780 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 MTG2Q9H4K7 406 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 PSTPIP2Q9H939 334 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 GKN1Q9NS71 199 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 STARD5Q9NSY2 213 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 OBP2AQ9NY56 170 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 TBX20Q9UMR3 447 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 NID2Q14112 1375 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ITPR2Q14571 2701 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 GRID2IPA4D2P6 1211 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 K7EQS6 105 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 PRRG1O14668 218 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 MFAP3LO75121 409 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 STC2O76061 302 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 PRAMEF12O95522 483 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 AKAP5P24588 427 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 KIF5BP33176 963 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CLDN6P56747 220 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 BNC1Q01954 994 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ROR1Q01973 937 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ZNF33AQ06730 810 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 GRIK2Q13002 908 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 PTPAQ15257 358 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 NAB2Q15742 525 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 KIF18BQ86Y91 864 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ZZZ3Q8IYH5 903 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ZNF276Q8N554 614 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 LEMD2Q8NC56 503 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ST8SIA2Q92186 375 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 ZG16BQ96DA0 208 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 NXPE2Q96DL1 559 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 HIC2Q96JB3 615 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CXCL16Q9H2A7 254 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 EBF3Q9H4W6 596 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
HERC1-211ENST00000560983 OXSMQ9NWU1 459 aa4.11□□□□□ -1.75
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