RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 SH3BP5O60239 455 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MFAP3LO75121 409 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 IGLV3-19P01714 112 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CDH18Q13634 790 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ALFQ53S48 1182 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 NAXDQ8IW45 347 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC185Q8N715 623 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 OR2I1PQ8NGU4 316 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ALG14Q96F25 216 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 GPR174Q9BXC1 333 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM5Q9C035 493 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.6■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CER1O95813 267 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF883P0CG24 379 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 PRKCHP24723 683 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CSKP41240 450 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 TPMTP51580 245 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM193AP78312 1265 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 GRIK2Q13002 908 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MANEALQ5VSG8 457 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 APCDD1Q8J025 514 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 NTAN1Q96AB6 310 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF653Q96CK0 615 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MYO19Q96H55 970 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM245Q9H330 911 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CD93Q9NPY3 652 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 NEU3Q9UQ49 428 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.59■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 METTL12A8MUP2 240 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 E9PAM4 449 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM72CH0Y354 149 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 EPHX1P07099 455 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MAOBP27338 520 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF75DP51815 510 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 SCAPQ12770 1279 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 TMC6Q7Z403 805 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 VPS36Q86VN1 386 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM72BQ86X60 149 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CHP1Q99653 195 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MPP6Q9NZW5 540 aa20.58■□□□□ 0.89
RABGGTA-210ENST00000559586 SPEGQ15772 3267 aa20.58■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 CLDN11O75508 207 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 MYBL1P10243 752 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 PLK1P53350 603 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 CDH4P55283 916 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 GLRX5Q86SX6 157 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM11Q96F44 468 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 THAP2Q9H0W7 228 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 FBRSQ9HAH7 460 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD62A6NC57 917 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 HLA-EP13747 358 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC18A3Q16572 532 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 TC2NQ8N9U0 490 aa20.56■□□□□ 0.88
RABGGTA-210ENST00000559586 OR2T3Q8NH03 318 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms