RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556339.5

ATXN3-240, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 525 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-240	ENST00000556339	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DDHD2	O94830	711 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	STBD1	O95210	358 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	BMP15	O95972	392 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TUBB	P07437	444 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	AKAP5	P24588	427 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MGAT1	P26572	445 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	APBA1	Q02410	837 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NHLH2	Q02577	135 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	STK38	Q15208	465 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	STAM	Q92783	540 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GAD1	Q99259	594 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ZBP1	Q9H171	429 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	INPPL1	O15357	1258 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SLITRK3	O94933	977 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GLUD1	P00367	558 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MLH1	P40692	756 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GLUD2	P49448	558 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PTEN	P60484	403 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CCZ1B	P86790	482 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MYL5	Q02045	173 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TDG	Q13569	410 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	CCDC51	Q96ER9	411 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-240	ENST00000556339	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73

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