RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698		A0A1W2PQF6	199 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698		K7ESF4	209 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	CBX4	O00257	560 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	TDGF1	P13385	188 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	HOXB2	P14652	356 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	GLDC	P23378	1020 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	HOXA6	P31267	233 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	DGKE	P52429	567 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ST8SIA6	P61647	398 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	IL31	Q6EBC2	164 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		21.93	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	CTNNA2	P26232	953 aa		21.92	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SERINC3	Q13530	473 aa		21.92	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	TAZ	Q16635	292 aa		21.92	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	PEX26	Q7Z412	305 aa		21.92	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	PQLC3	Q8N755	202 aa		21.92	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	HMCES	Q96FZ2	354 aa		21.92	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	21.92	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		21.92	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		21.92	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCDC66	A2RUB6	948 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	KDELR3	O43731	214 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ATP9B	O43861	1147 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	MT-CO1	P00395	513 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	COL9A1	P20849	921 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	PEX5	P50542	639 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARF5	P84085	180 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC20A2	Q08357	652 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANGPT1	Q15389	498 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	EXD1	Q8NHP7	514 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	RNF157	Q96PX1	679 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRRX2	Q99811	253 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	AMFR	Q9UKV5	643 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	RAD54B	Q9Y620	910 aa		21.91	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	TTC34	A8MYJ7	566 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	FTCD	O95954	541 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	EPHX1	P07099	455 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	HLA-E	P13747	358 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	NNMT	P40261	264 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	CDKN2B	P42772	138 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	STARD3	Q14849	445 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ODF2	Q5BJF6	829 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	LINGO4	Q6UY18	593 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	FRS2	Q8WU20	508 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	HHIP	Q96QV1	700 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		21.9	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZSCAN12	O43309	604 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	APBB3	O95704	486 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	CD160	O95971	181 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SRC	P12931	536 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SERPINB6	P35237	376 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	CLCN6	P51797	869 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	TSSK4	Q6SA08	328 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF366	Q8N895	744 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ALG3	Q92685	438 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	SUN2	Q9UH99	717 aa		21.89	■■□□□ 1.1
SDR39U1-208	ENST00000554698	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		21.88	■■□□□ 1.09
SDR39U1-208	ENST00000554698		K7ERQ8	282 aa		21.88	■■□□□ 1.09
SDR39U1-208	ENST00000554698	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	21.88	■■□□□ 1.09
SDR39U1-208	ENST00000554698	RWDD2B	P57060	319 aa		21.88	■■□□□ 1.09
SDR39U1-208	ENST00000554698	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	21.88	■■□□□ 1.09
SDR39U1-208	ENST00000554698	RASSF3	Q86WH2	238 aa		21.88	■■□□□ 1.09
SDR39U1-208	ENST00000554698	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		21.88	■■□□□ 1.09
SDR39U1-208	ENST00000554698	NETO2	Q8NC67	525 aa		21.88	■■□□□ 1.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms