RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SGPL1	O95470	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	CD4	P01730	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	NR4A2	P43354	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	MTA1	Q13330	715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	NCSTN	Q92542	709 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	PIGK	Q92643	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	CD180	Q99467	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	MROH8	Q9H579	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	TLR2	O60603	784 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	TULP3	O75386	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SOX2	P48431	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	TDG	Q13569	410 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	BAK1	Q16611	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	KAT2B	Q92831	832 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876		B4E171	279 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	INPPL1	O15357	1258 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	USP12	O75317	370 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	TBX18	O95935	607 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	PLAU	P00749	431 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	FGB	P02675	491 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	CTSA	P10619	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	ABCD3	P28288	659 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	TYK2	P29597	1187 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	HNF1B	P35680	557 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	GGT5	P36269	586 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	TSPAN7	P41732	249 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	GPD2	P43304	727 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	CASP6	P55212	293 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM23-208	ENST00000553876	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms