RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	PLXNA3	P51805	1871 aa		12.08	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXA2	O43364	376 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	RFPL1	O75677	317 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	UBOX5	O94941	541 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	GJB5	O95377	273 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	FYN	P06241	537 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PYGB	P11216	843 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	COL6A2	P12110	1019 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	THPO	P40225	353 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ARFIP2	P53365	341 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	WASHC5	Q12768	1159 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ASPH	Q12797	758 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CDH17	Q12864	832 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	NME3	Q13232	169 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	POTEH	Q6S545	545 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF534	Q76KX8	674 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	RDH11	Q8TC12	318 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	C10orf82	Q8WW14	230 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CFAP36	Q96G28	342 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	TEKT5	Q96M29	485 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ZFP42	Q96MM3	310 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINB11	Q96P15	392 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PKMYT1	Q99640	499 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	WWP1	Q9H0M0	922 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CASS4	Q9NQ75	786 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CLDND1	Q9NY35	253 aa		12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	OR6C75	A6NL08	312 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CREB3	O43889	395 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	MFSD11	O43934	449 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP2C2	O75185	946 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ADRA1D	P25100	572 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPN3	P26045	913 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CRYM	Q14894	314 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ICE2	Q659A1	982 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	KCTD11	Q693B1	232 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CASC4	Q6P4E1	433 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF567	Q8N184	647 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	MYLPF	Q96A32	169 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	E2F7	Q96AV8	911 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ZFAT	Q9P243	1243 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	SCML2	Q9UQR0	700 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		12.06	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PROB1	E7EW31	1015 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	BPGM	P07738	259 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	USP17L7	P0C7H9	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PAM	P19021	973 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CALB2	P22676	271 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPN4	P29074	926 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	EPHB2	P29323	1055 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	NDST2	P52849	883 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	GEM	P55040	296 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	NCALD	P61601	193 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	DEFB103A	P81534	67 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	TNK2	Q07912	1038 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	LPIN1	Q14693	890 aa		12.05	□□□□□ -0.48

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