RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549123.5

TCTN1-222, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2

Gene TCTN1, Length 458 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-222	ENST00000549123	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A087WWV3	80 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A1W2PS29	197 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	CHRNA1	P02708	482 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	CD1A	P06126	327 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	CYP11B2	P19099	503 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ARL2	P36404	184 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF844	Q08AG5	666 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	DRP2	Q13474	957 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	GPNMB	Q14956	572 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ODF1	Q14990	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	EMC2	Q15006	297 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	MIER2	Q8N344	545 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	RAD54L	Q92698	747 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	APBB2	Q92870	758 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A087WZ62	844 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123		A0A1W2PPC1	479 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	PRAMEF10	O60809	474 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	FGB	P02675	491 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	VTN	P04004	478 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	GHR	P10912	638 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ACTN1	P12814	892 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	GLRA2	P23416	452 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	CMA1	P23946	247 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ME1	P48163	572 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	GPC3	P51654	580 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	DSC2	Q02487	901 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	LPIN1	Q14693	890 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	SEPT8	Q92599	483 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM143	Q96AN5	459 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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