RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549007.1

APAF1-208, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 3,492 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APAF1-208	ENST00000549007	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	RAET1E	Q8TD07	263 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	TRIB2	Q92519	343 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	MROH8	Q9H579	483 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	GJB3	O75712	270 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	CYP7B1	O75881	506 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	AMH	P03971	560 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	IDE	P14735	1019 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	CD6	P30203	668 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FHL3	Q13643	280 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	CUL5	Q93034	780 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.06	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007		H3BQV1	296 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF185	O15231	689 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	RECQL4	O94761	1208 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	KRT20	P35900	424 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	KCNC1	P48547	511 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	POLD2	P49005	469 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	TSPY1	Q01534	308 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007		B5MCH6	92 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ZFPL1	O95159	310 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	PRKCB	P05771	671 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	SYT1	P21579	422 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	DRD1	P21728	446 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	SERPINA4	P29622	427 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	RGS2	P41220	211 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	HSD17B4	P51659	736 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	CCR9	P51686	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	SP4	Q02446	784 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	TRIM29	Q14134	588 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	BECN1	Q14457	450 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ARMCX2	Q7L311	632 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	USP6NL	Q92738	828 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
APAF1-208	ENST00000549007	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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