RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 PITRM1Q5JRX3 1037 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CFAP58Q5T655 872 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 HTR3DQ70Z44 454 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TAF4BQ92750 862 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PSMB7Q99436 277 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 RDH14Q9HBH5 336 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CNGB3Q9NQW8 809 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CD84Q9UIB8 345 aa7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 MED7O43513 233 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 BUB1O43683 1085 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CXCR3P49682 368 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ECT2LQ008S8 904 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 STX1AQ16623 288 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 MPPE1Q53F39 396 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TRIM5Q9C035 493 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 KLC2Q9H0B6 622 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 USP3Q9Y6I4 520 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 F8VZ95 297 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 MYO1CO00159 1063 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.73□□□□□ -1.171e-14■■□□□ 14.3
CS-212ENST00000548567 PIGNO95427 931 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PSMA2P25787 234 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CNTN1Q12860 1018 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 MMRN1Q13201 1228 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 DNAJC24Q6P3W2 148 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SYT10Q6XYQ8 523 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CCNYQ8ND76 341 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PRRX2Q99811 253 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 KLHL3Q9UH77 587 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FBXO10Q9UK96 956 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 AK5Q9Y6K8 562 aa7.73□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SLC26A4O43511 780 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SEMA4FO95754 770 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SETSIPP0DME0 302 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CTPS1P17812 591 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.72□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 43.3
CS-212ENST00000548567 CASP14P31944 242 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SLC6A3Q01959 620 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CYP4F3Q08477 520 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 GRIK2Q13002 908 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 HLA-BQ31612 363 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FBXO43Q4G163 708 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 LRRC31Q6UY01 552 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 LGMNQ99538 433 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 DYRK4Q9NR20 520 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 KLK13Q9UKR3 277 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 POM121BA6NF01 834 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 J3KR12 359 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 IRAK2O43187 625 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 MMP20O60882 483 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 BIRC2Q13490 618 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 NFIL3Q16649 462 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CDKN3Q16667 212 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 TRIM74Q86UV6 250 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 CAMK1DQ8IU85 385 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 GPR65Q8IYL9 337 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 RBFAQ8N0V3 343 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 SHC3Q92529 594 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-212ENST00000548567 ZNF592Q92610 1267 aa7.72□□□□□ -1.17
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