RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM247	A6NEH6	219 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	SEPT4	O43236	478 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	KRT38	O76015	456 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	CSF1	P09603	554 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	CYP4B1	P13584	511 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	KLRC2	P26717	231 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	GSTM2	P28161	218 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	AVPR2	P30518	371 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ARRB2	P32121	409 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	TNFSF8	P32971	234 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ADD2	P35612	726 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	PNPLA4	P41247	253 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	RPS6KA3	P51812	740 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	3.3	□□□□□ -1.88	2e-8	■□□□□ 9.8
MDM2-233	ENST00000545204	CUL4B	Q13620	913 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	PKP1	Q13835	747 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	PRKG1	Q13976	671 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	POSTN	Q15063	836 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	RUBCN	Q92622	972 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	FRG2B	Q96QU4	278 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	UPB1	Q9UBR1	384 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	C17orf100	A8MU93	164 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	SYN3	O14994	580 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	DDAH2	O95865	285 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	TK1	P04183	234 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	FCGR2A	P12318	317 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ARSA	P15289	507 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	PRKCH	P24723	683 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	CCKAR	P32238	428 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	GRK6	P43250	576 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	RFX2	P48378	723 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	SELENOV	P59797	346 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	AADACL2	Q6P093	401 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	DPP10	Q8N608	796 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ISCU	Q9H1K1	167 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ACAD9	Q9H845	621 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	RMI1	Q9H9A7	625 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	THAP1	Q9NVV9	213 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		3.29	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204		A0A0A0MQY5	61 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	PEX14	O75381	377 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	TCEA3	O75764	348 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	TMCC1	O94876	653 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	METTL18	O95568	372 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	CHRNB2	P17787	502 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	MVD	P53602	400 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ACTR2	P61160	394 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	DUSP6	Q16828	381 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	SYTL3	Q4VX76	610 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	ANO1	Q5XXA6	986 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	SCAI	Q8N9R8	606 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	BICD2	Q8TD16	824 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	FAR1	Q8WVX9	515 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	IFT27	Q9BW83	186 aa		3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	3.28	□□□□□ -1.88
MDM2-233	ENST00000545204	KLHL31	Q9H511	634 aa		3.28	□□□□□ -1.88

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