RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ARCQ7LC44 396 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ERICH1Q86X53 443 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 OR14C36Q8NHC7 312 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 GANCQ8TET4 914 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC20A1Q8WUM9 679 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CPA5Q8WXQ8 436 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 VOPP1Q96AW1 172 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 MAGEB5Q9BZ81 275 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TAB2Q9NYJ8 693 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 HS3ST2Q9Y278 367 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CEP83Q9Y592 693 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa12.13□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRC72A6NJI9 287 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FLRT2O43155 660 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 RTN2O75298 545 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ZMPSTE24O75844 475 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 LSM8O95777 96 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CD160O95971 181 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 F9P00740 461 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SRCP12931 536 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 NNMTP40261 264 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SULT1E1P49888 294 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FMO1Q01740 532 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 DEUP1Q05D60 604 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CNTN1Q12860 1018 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PTP4A2Q12974 167 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 KRT31Q15323 416 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 AGBL4Q5VU57 503 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZVU0 165 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 OR2A12Q8NGT7 310 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PCDHB18PQ96TA0 734 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 VPS16Q9H269 839 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SYNCQ9H7C4 482 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 FANCLQ9NW38 375 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 MPP6Q9NZW5 540 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 DACH1Q9UI36 760 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 VPS51Q9UID3 782 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 VPS28Q9UK41 221 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SIK3Q9Y2K2 1263 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 KNTC1P50748 2209 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 DOCK4Q8N1I0 1966 aa12.12□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D3EA0A087X179 549 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRC10BA6NIK2 292 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D3LB9A6J9 549 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC7A4O43246 635 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D3HP0C7X1 549 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 UNGP13051 313 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 MMP8P22894 467 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 GLDCP23378 1020 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CD38P28907 300 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 IL9RQ01113 521 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SCAPQ12770 1279 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ACCSLQ4AC99 568 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 NAA35Q5VZE5 725 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 MARCH9Q86YJ5 346 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 SAP25Q8TEE9 199 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 OR8D1Q8WZ84 308 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CFAP57Q96MR6 1250 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 HAPLN3Q96S86 360 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PPP1R9BQ96SB3 815 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CDC6Q99741 560 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 HSD3B7Q9H2F3 369 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 STAP1Q9ULZ2 295 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 PKD1L2Q7Z442 2459 aa12.11□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 E9PAM4 449 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 GOLGA8SH3BPF8 625 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TLR4O00206 839 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ALOX15BO15296 676 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TNFSF14O43557 240 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 DFNA5O60443 496 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 GFPT2O94808 682 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF18P17022 549 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 RRM1P23921 792 aa12.1□□□□□ -0.47
CLSTN3-211ENST00000541667 RDXP35241 583 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms